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Assorbanza

Essenziale per ELISA, quantificazione degli acidi nucleici, analisi delle proteine e altro ancora. Scoprite come i nostri lettori forniscono misure precise e affidabili per un'ampia gamma di applicazioni.

Che cos'è l'assorbanza?

In generale, l'assorbanza è un processo di interazione della luce con la materia. Quando la luce colpisce qualcosa che ne assorbe una parte, si parla di assorbanza. Naturalmente, la luce assorbita non va persa, ma viene trasformata in calore o energia chimica quando la molecola assorbente si eccita. L'assorbanza è un processo fisico che incontriamo ogni giorno quando vediamo i colori: La luce bianca, come quella del sole, contiene tutti i colori della luce visibile. Quando brilla sull'erba verde, questa assorbe tutti i colori tranne il verde. La luce verde viene riemessa ed è questo che dà all'erba il suo colore.

Figura 1. a) L'assorbimento è il fenomeno per cui la luce viene assorbita dalla materia. Ad esempio, l'erba assorbe tutta l'energia tranne quella della luce verde che viene riemessa.

Fig. 1: b) Il colore delle piante è dato dalla clorofilla. Il suo spettro di assorbimento mostra l'assorbimento della luce blu e rossa, ma non di quella verde.

 

Perché misurare l'assorbanza?

In biologia e in chimica, il principio dell'assorbanza viene utilizzato per quantificare le molecole assorbenti in soluzione. Molte biomolecole assorbono a lunghezze d'onda specifiche. Gli acidi nucleici e le proteine assorbono la luce UV, la clorofilla assorbe la luce blu e arancione/rossa e l'emoglobina assorbe la luce giallo-verde. Questi analiti possono essere quantificati senza ulteriori procedimenti, almeno se si trovano in una soluzione con bassa assorbanza di fondo. Tuttavia, la quantificazione dell'assorbanza non è limitata a una manciata di molecole assorbenti. Le reazioni chimiche aiutano a produrre molecole assorbenti per la quantificazione. Queste reazioni dipendono da un substrato specifico o da un enzima. Di conseguenza, lo sviluppo del colore (e dell'assorbanza) è tanto più intenso quanto maggiore è la quantità di composto/enzima presente nel campione. Più avanti sono riportati numerosi esempi di misure di assorbanza, dalla misurazione della vitalità cellulare alla concentrazione di proteine con i test proteici.

Sfondo teorico delle misure di assorbanza

Percorso di rivelazione in cuvette e micropiastre

Tradizionalmente, le misure di assorbanza venivano eseguite in una cuvetta: Una soluzione con un analita dalle caratteristiche di assorbanza note viene posta in una cuvetta. Un lettore di assorbanza determina l'assorbanza inviando una luce di intensità nota attraverso il campione e rilevando l'intensità dietro il campione. La luce che non arriva al rilevatore viene assorbita o dispersa. La parte dispersa viene determinata separatamente misurando opportuni bianchi e viene sottratta da questo valore per ottenere l'assorbanza pura della sostanza di interesse.

Fig. 2: l'assorbanza viene misurata inviando luce attraverso il campione e rilevando la parte trasmessa.

 

Il risultato delle misure di assorbanza - trasmissione, assorbanza e densità ottica

La porzione di luce che riesce a passare il campione è detta anche trasmissione e viene indicata principalmente in percentuale (Fig. 2). Più l'analita si trova in soluzione, più la luce viene assorbita da esso e più bassa è la trasmissione. L'assorbanza, invece, è la parte di luce assorbita dall'analita. È il valore assoluto del logaritmo (alla potenza di 10) della trasmissione1. Ecco le equazioni matematiche e alcuni numeri che spiegano cosa si intende per trasmissione e assorbanza:

Fig. 3: Relazione matematica tra assorbanza e trasmissione.

 

Trasmissione: T =Iout /Iin
Assorbanza: A =-log10T

 

Tabella 1: Esempi di valori di trasmissione e di assorbanza

 

Trasmissione Assorbanza
0,1 (o 10%) 1 OD
0,01 (o 1%) 2 OD
0,001 (o 0,1%) 3 OD

 

Assorbanza in chimica e scienze biologiche - quantificare una sostanza in soluzione

Dopo aver eseguito una misura di assorbanza, il risultato è un valore dato in trasmissione o in densità ottica. Tuttavia, se l'obiettivo della misurazione è la quantificazione di una sostanza in soluzione, la domanda ovvia è come convertire il segnale in un valore di concentrazione. In generale, esistono due modi: impiegando la legge di Beer-Lambert o misurando una curva standard in parallelo a campioni di concentrazione sconosciuta.

 

Legge di Beer-Lambert

La legge di Beer-Lambert descrive la relazione tra assorbanza, lunghezza del percorso e concentrazione di una sostanza assorbente:

A=c*d*ε
Modificata in c: c=A/(d*ε)

Legge di Beer-Lambert con A - assorbanza, c - concentrazione, d - lunghezza del cammino ottico, ε - coefficiente di estinzione.

 La legge dice che l'assorbanza è lineare rispetto alla concentrazione moltiplicata per la lunghezza del percorso e il coefficiente di estinzione. La lunghezza del cammino ottico si riferisce alla lunghezza del campione che la luce deve attraversare. Ad esempio, in una cuvetta il percorso è standardizzato a 1 cm. Il coefficiente di estinzione è una costante specifica per una sostanza assorbente e una specifica lunghezza d'onda, in genere il massimo di assorbanza della sostanza. Fornisce informazioni sulla forza con cui la sostanza specifica assorbe la luce alla specifica lunghezza d'onda. Ad esempio, il coefficiente di estinzione di massa della sieroalbumina bovina (BSA) è di 0,67 µl*cm-1*µg-1. Di conseguenza, una soluzione di 1 µg/µl di BSA con una lunghezza di percorso di 1 cm ha un'assorbanza di 0,67 OD.

La legge di Beer-Lambert è molto utile perché consente di quantificare le sostanze assorbenti senza la necessità di aggiungere altri reagenti. Tuttavia, è limitata come indicato di seguito.

La legge di Beer-Lambert può essere utilizzata solo se

  • l'analita assorbe la luce a una specifica lunghezza d'onda
  • La lunghezza del cammino ottico è nota
  • Il coefficiente di estinzione dell'analita è noto.
  • L'assorbanza dei reagenti tampone non si sovrappone all'assorbanza dell'analita.

 

Utilizzo di una curva standard

Se uno di questi criteri non è applicabile, esiste la possibilità di misurare indirettamente gli analiti e/o di utilizzare una curva standard. Ad esempio, i saggi colorimetrici per la quantificazione delle proteine, come il saggio di Bradford, dipendono da una sostanza che aumenta l'assorbanza in presenza di proteine. L'aumento viene misurato in una curva standard con concentrazioni note di proteine e nei campioni, in modo da poterne calcolare la concentrazione.

Fig. 4: Il menisco di una superficie liquida modifica la lunghezza del percorso nei pozzetti delle micropiastre.

 

Come viene rilevata l'assorbanza?

Fonte di luce

Si spiega da sé: la misurazione della trasmissione/assorbimento della luce richiede innanzitutto la luce. Per la misurazione dell'assorbanza si possono utilizzare diverse sorgenti luminose. Esse si differenziano per l'intervallo spettrale coperto, per l'intensità e per la stabilità della luce emessa.

Le lampade alogene al tungsteno coprono l'intervallo da 360 nm a oltre 1000 nm e sono spesso utilizzate per la loro economicità. Le lampade allo xeno, invece, coprono la regione spettrale da 220 nm a 1000 nm e coprono la gamma UV dello spettro. Ciò rende possibile il rilevamento e la quantificazione degli acidi nucleici (260 nm) e delle proteine (280 nm). I lettori di micropiastre ad assorbanza BMG LABTECH sono dotati di una lampada allo xeno per le misure di assorbanza e quindi offrono la massima flessibilità per misurare qualsiasi lunghezza d'onda tra 220 e 1000 nm, o l'intero spettro di lunghezze d'onda.

 

Campione

I liquidi di interesse devono essere trasferiti in una cuvetta o in una micropiastra per poterne misurare l'assorbanza. Il materiale della cuvetta e della micropiastra è sempre trasparente per garantire la massima trasmissione della luce, poiché l'assorbanza della soluzione e non del materiale è di interesse per il ricercatore. Tuttavia, esistono diversi materiali comuni che si differenziano tra loro. Il polistirene è il più utilizzato e può essere modificato per fornire specifiche caratteristiche di legame, sia per colture cellulari che per applicazioni ELISA. Tuttavia, non sono trasmissibili nella gamma UV, il che richiede l'uso di piastre speciali di copolimero olefinico ciclico per misurare l'assorbanza al di sotto dei 400 nm.

 

Volume del campione

Un secondo aspetto da considerare è il volume del campione necessario per ottenere misure di assorbanza affidabili. Le cuvette standard richiedono circa 4,5 ml, mentre le cuvette a semi-micro volume consentono di ridurre il volume a 1,5 ml e le cuvette a micro volume se la cavano con 70 µl. La misurazione in cuvetta è orizzontale: la luce viene diretta da un lato nel campione e sul lato opposto viene rilevata la luce trasmessa. Pertanto, la geometria delle cuvette fornisce una lunghezza di percorso standardizzata di 1 cm. Questa è una delle principali differenze rispetto alle misure su micropiastra, che si svolgono in verticale (dall'alto verso il basso o dal basso verso l'alto). Di conseguenza, la lunghezza del cammino ottico varia anche con il volume del campione e richiede l'uso di volumi uguali per un esperimento. Inoltre, gli effetti del menisco giocano un ruolo importante per la lunghezza del percorso nelle misure di assorbanza su micropiastra, come spiegato in dettaglio nella  nota HowTo: Come gestire la lunghezza del percorso e il menisco nelle micropiastre.  Le misure eseguite al centro del pozzetto di una micropiastra hanno un cammino ottico molto più breve in presenza di un forte menisco rispetto a una misura senza menisco. Ciò è di particolare importanza quando si applica il metodo di Beer-Lambert o quando si hanno menischi molto variabili in un esperimento. Nelle soluzioni acquose è possibile correggere le variazioni di lunghezza di percorso dipendenti dal menisco sfruttando l'assorbanza dell'acqua (correzione della lunghezza di percorso del picco d'acqua).

In genere si utilizzano piastre standard a 96 pozzetti con volumi di campione compresi tra 100 e 300 µl, che si traducono in una lunghezza di percorso approssimativa compresa tra 2,9 e 7,4 mm. Potrebbe essere necessario ridurre ulteriormente il volume del prezioso campione senza compromettere la lunghezza del percorso. A tal fine, si possono utilizzare piastre a metà area o a densità più elevata. Esse offrono un'area di pozzetti più piccola ma la stessa altezza delle piastre standard da 96 pozzetti e, quindi, forniscono lunghezze di percorso elevate con volumi inferiori.

 

Il bianco appropriato

Per correggere le misure di assorbanza da assorbanze indesiderate provenienti da componenti del tampone, dalla piastra e da effetti di dispersione della luce, si misura un bianco in parallelo ai campioni. Il bianco appropriato contiene tutti i componenti del test tranne l'analita. Al contrario, ciò significa che un bianco di PBS o di acqua è spesso insufficiente.

Occorre prestare particolare attenzione alle particelle presenti nei campioni analizzati e nei bianchi. Le particelle disperdono la luce e aumentano il valore di assorbanza misurato, poiché meno luce raggiunge il rivelatore. Quando le particelle si muovono nella soluzione, vengono rilevate quando bloccano il percorso della luce. Quando si spostano fuori dal percorso di rilevamento, non vengono misurate. Questo fenomeno aumenta la variabilità dei dati di assorbanza. Se non è possibile rimuovere le particelle dalle soluzioni misurate, si raccomanda di coprire un'area più ampia del pozzetto della micropiastra nella misurazione dell'assorbanza, una caratteristica che tutti i dispositivi BMG LABTECH offrono per le misure di assorbanza.Fig. 5: Le opzioni di scansione dei pozzetti nei lettori di micropiastre BMG LABTECH riducono la variabilità delle misurazioni dell'assorbanza in presenza di particelle.

 

Rivelatore delle misure di assorbanza

Dopo che la luce trasmessa ha superato il campione, deve essere rilevata. Nei lettori di micropiastre vengono comunemente utilizzati due diversi tipi di rilevatori: un tubo fotomoltiplicatore (PMT) o uno spettrometro CCD. I sistemi basati su PMT richiedono la selezione della lunghezza d'onda prima della rilevazione. Ciò avviene tramite filtri ottici o monocromatori che selezionano la lunghezza d'onda desiderata prima di guidarla verso il campione. La luce trasmessa della lunghezza d'onda desiderata raggiunge quindi il PMT. Il PMT amplifica il segnale della luce trasmessa e produce una tensione indicativa della sua intensità. Per eseguire la scansione dell'assorbanza su una gamma di lunghezze d'onda, i sistemi basati su PMT utilizzano un monocromatore che seleziona la lunghezza d'onda desiderata per ogni punto dello spettro e la misura in sequenza.

Questa è la differenza principale rispetto al secondo tipo di rilevatori di assorbanza, lo spettrometro. Esso divide la luce trasmessa in diverse lunghezze d'onda che vengono dirette su un rilevatore CCD, catturando l'intensità di tutte le lunghezze d'onda contemporaneamente. In questo modo, gli spettri e le misurazioni di singole o poche lunghezze d'onda possono essere acquisiti in un tempo simile. Ad esempio, gli strumenti BMG LABTECH utilizzano spettrometri UV/vis per misure di assorbanza che acquisiscono un intero spettro (220 1000 nm) in meno di un secondo.

Fig. 6: uno spettrometro UV/vis, utilizzato come rilevatore di assorbimento, acquisisce l'intero spettro di assorbimento (220-1000) in una sola volta.

 

Insidie nelle misure di assorbanza

Utilizzo di una piastra sbagliata

Quando si effettuano misure nell'intervallo UV, come nel caso degli acidi nucleici o del NADH, è assolutamente necessario utilizzare piastre trasparenti agli UV. In caso contrario, la misurazione dell'assorbanza risulterà nella massima assorbanza di tutti i campioni.

 

Confronto tra misure in cuvetta e in micropiastra

La lunghezza del percorso nelle cuvette è normalizzata a 1 cm, mentre nelle micropiastre varia in base al volume e al formato della piastra. Pertanto, l'assorbanza acquisita in micropiastra è tipicamente inferiore all'assorbanza della stessa soluzione misurata in cuvetta. Se si misurano soluzioni acquose, la misura su micropiastra può essere normalizzata a 1 cm utilizzando la correzione della lunghezza del percorso del picco d'acqua. La determinazione della lunghezza del percorso consente inoltre di calcolare le concentrazioni degli analiti con la legge di Beer-Lambert.

 

Utilizzo di volumi diversi

Per le misure in micropiastra si raccomanda di utilizzare sempre lo stesso volume per generare la stessa lunghezza di percorso per tutti i campioni. Tuttavia, nei campioni con menisco, la lunghezza del percorso può essere diversa nonostante l'uso dello stesso volume. Anche in questo caso, per le soluzioni acquose è possibile utilizzare la correzione della lunghezza del percorso del picco d'acqua per superare il problema o per determinare la lunghezza del percorso per i calcoli di Beer-Lambert.

 

Disturbi del percorso ottico della luce

Qualsiasi cosa si trovi nel percorso ottico della luce aumenterà l'assorbanza misurata. Spesso si tratta di bolle d'aria nel campione, condensa sul coperchio, polvere, graffi o impronte digitali sul fondo della piastra. Si consiglia quindi di controllare la piastra subito prima della misurazione.

Cosa si misura tipicamente con l'assorbanza?

Quantificazione delle proteine

Molte misure di assorbanza mirano a determinare la concentrazione delle proteine in soluzione. Sono disponibili diversi metodi colorimetrici per misurare l'intero contenuto proteico di un campione. Ciò è necessario per normalizzare i campioni di proteine prima delle applicazioni a valle, come i western blot o le immunoprecipitazioni. Nell'articolo del nostro blog "Misurazione delle proteine: trovare un metodo adatto" troverete descrizioni dettagliate di Bradford, BCA e altri metodi e consigli per aiutarvi nella scelta.

 

Quantificazione degli acidi nucleici

Gli acidi nucleici e i loro componenti presentano un'assorbanza naturale a 260 nm. Senza bisogno di alcuna preparazione del campione o procedura di colorazione, le misure di assorbanza a questa lunghezza d'onda possono essere sfruttate per determinare la concentrazione di DNA/RNA in modo rapido e semplice. Effettuando ulteriori misurazioni ad altre lunghezze d'onda, come 230 nm, 280 nm o 340 nm, è possibile valutare la purezza degli acidi nucleici.

 

ELISA

Utilizzando l'assorbanza, è anche possibile quantificare una specifica proteina in soluzione. Un metodo molto diffuso è il saggio di immunoassorbimento enzimatico (ELISA). In breve, un anticorpo immobilizzato nel pozzetto della micropiastra si lega specificamente alla proteina di interesse e la cattura nella piastra. Un secondo anticorpo, anch'esso specifico per la proteina di interesse, si lega alla proteina catturata e può essere riconosciuto da un anticorpo secondario dotato di enzima. Di conseguenza, maggiore è la quantità di proteine di interesse presenti nel campione, maggiore sarà la quantità di enzima legato nel pozzetto della micropiastra. Un substrato convertito dall'enzima in un cromoforo può infine essere misurato mediante assorbanza e riportare la quantità della proteina specifica presente nelcampione3.

 

Vitalità cellulare

I saggi colorimetrici che forniscono informazioni sullo stato di salute delle cellule sono molto diffusi perché sono rapidi ed economici. Utilizzando una micropiastra è possibile testare molte condizioni contemporaneamente. I metodi basati sull'assorbanza si basano principalmente sulla capacità delle cellule metabolicamente attive di ridurre substrati come MTT o Resazurin. Le loro forme ridotte mostrano l'assorbanza a lunghezze d'onda specifiche e quindi riportano l'attività metabolica di un campione di cellule, una caratteristica spesso influenzata dalla vitalità cellulare4. Il nostro post sulla vitalità cellulare descrive in dettaglio i metodi colorimetrici e altri metodi per misurare la salute delle cellule.

 

Crescita microbica

La modalità di lettura dell'assorbanza dei lettori di micropiastre e dei fotometri determina la moltiplicazione di batteri e lieviti misurando la "densità ottica a 600 nm" (OD600). A rigore, in questa modalità di misurazione si misura la dispersione della luce5 e non l'assorbanza. Le particelle (batteri o lieviti) nelle sospensioni microbiche diffondono la luce: più microbi sono presenti in soluzione, più luce viene diffusa. Ciò significa anche che meno luce raggiunge il rivelatore e la trasmissione misurata è inferiore. In questo modo, si calcola un assorbimento più elevato per un numero maggiore di microbi, anche se questo cambiamento è causato esclusivamente da un aumento della dispersione della luce anziché dell'assorbanza specifica a 600 nm.

Riferimenti

  1. IUPAC, Compendio di terminologia chimica, 2a ed. (il "Libro d'oro") (1997). Versione corretta online: (2008) "Absorbance". doi:10.1351/goldbook.A00028
  2. IUPAC, Compendio di terminologia chimica, 2a ed. (il "Libro d'oro") (1997). Versione corretta online: (2014) "Legge di Beer-Lambert (o legge di Beer-Lambert-Bouguer)". doi:10.1351/goldbook.B00626
  3. Crowther, J.R. (1995). Capitolo 2: Principi di base dell'ELISA. ELISA: Teoria e pratica. Humana Press. pp. 35-62. ISBN 0896032795.
  4. Riss, T. L. (2013) Saggi di vitalità cellulare. Assay Guidance Manual. Bethesda (MD): Eli Lilly & Company e il National Center for Advancing Translational Sciences. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK144065/.
  5. Keiran Stevenson et al. (2016) Calibrazione generale della crescita microbica nei lettori di micropiastre. Scientific Reports volume 6, numero di articolo: 38828 (2016) https://doi.org/10.1038/srep38828
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